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Type: desktop-application
ID: ltrsift.desktop
Package: ltrsift
Name:
C: LTRsift
Summary:
C: A graphical tool for postprocessing and classification of LTR retrotransposons.
Description:
fr: >-
<p>LTRsift est un outil graphique de bureau pour le post-traitement semi-automatique d’annotations de rétrotransposons,
à séquence terminale longue répétée (LTR), de prédictions de novo, tels que ceux générés par LTRharvest et LTRdigest.
Son interface conviviale affiche les candidats de rétrotransposon, leurs familles putatives et leurs structures internes
de manière hiérarchique, permettant à l’utilisateur de « passer au crible » les résultats, parfois très importants, des
logiciels de prédiction de novo. Il propose aussi des fonctions de filtrage et classification.</p>
C: >-
<p>LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations,
such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates,
their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift"
through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification
functionality.</p>
da: >-
<p>LTRsift er et grafisk skrivebordsværktøj for semiautomatisk efterbehandling af de novo-forudsagte LTR-retrotransposon
annotationer, såsom dem oprettet af LTRharvest og LTRdigest. Dets brugervenlige grænseflade viser LTR-retrotransposon
kandidater, deres putative familier og deres interne struktur på en hierarkisk måde, der giver brugeren mulighed for at
»sift« igennem de undertiden omfangsrige resultater i de novo-forudsigelsesprogrammer. Værktøjet tilbyder også tilpasset
filtrering og klassifikationsfunktionalitet.</p>
it: >-
<p>LTRsift è uno strumento grafico per desktop che fa post-elaborazione semi-automatica delle annotazioni di retrotrasposoni
LTR predetti de novo, come quelle generate da LTRharvest e LTRdigest. La sua interfaccia facile da usare mostra i candidati
per i retrotrasposoni LTR, le loro famiglie putative e la loro struttura in modo gerarchico, permettendo all'utente
di "vagliare" ("sift") i risultati, a volte numerosi, del software di predizione de novo. Offre anche
funzionalità di filtraggio e di classificazione personalizzabili.</p>
de: >-
<p>LTRsift ist ein grafisches Werkzeug für die halbautomatische Nachbearbeitung von de-novo vorhergesagten Annotationen
von LTR-Retrotransposonen, etwa bei den von LTRharvest und LTRdigest erstellten. Die benutzerfreundliche Oberfläche zeigt
LTR-Retrotransposon-Kandidaten, deren mutmaßliche Familien und deren interne Struktur auf hierarchische Art an. Dadurch
wird es dem Benutzer ermöglicht die teilweise großen Resultate der de-novo-Vorhersage-Software zu »durchsieben« (sift).
Funktionen für anpassbares Filtern und Klassifizieren sind ebenso verfügbar.</p>
en: >-
<p>LTRsift is a graphical desktop tool for semi-automatic postprocessing of de novo predicted LTR retrotransposon annotations,
such as the ones generated by LTRharvest and LTRdigest. Its user-friendly interface displays LTR retrotransposon candidates,
their putative families and their internal structure in a hierarchical fashion, allowing the user to "sift"
through the sometimes large results of de novo prediction software. It also offers customizable filtering and classification
functionality.</p>
Categories:
- Biology
- Science
- Education
Keywords:
C:
- LTRsift
- ltr
- ltrsift
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stock: ltrsift
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Launchable:
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