---
Type: desktop-application
ID: avogadro.desktop
Package: avogadro
Name:
C: Avogadro
Summary:
fr: Système de modélisation et d'imagerie moléculaire
C: Molecular Graphics and Modelling System
da: Molekulært grafik- og modelsystem
it: Sistema di grafica e modellamento molecolare
pl: System do molekularnego modelowania i wizualizacji
de: System für Molekülgrafiken und -modellierung
ru: Система для молекулярного моделирования и визуализации
Description:
pl: >-
<p>Avogadro jest systemem do molekularnego modelowania oraz wizualizacji cząsteczek i biocząsteczek. Może wizualizować
właściwości cząsteczek, takie jak orbitale lub potencjały elektrostatyczne, a ponadto udostępnia intuicyjne narzędzie
do budowania cząsteczek.</p>
<p>Podstawowe możliwości: * molekularne modelowanie z automatyczną optymalizacją opartą na geometrii pól siłowych;
* mechanika molekularna obejmująca wyszukiwanie według ograniczeń i konformacji; * wizualizacja orbitali molekularnych
oraz ogólnych izopowierzchni; * wizualizacja drgań i kreślenie widm oscylacyjnych; * obsługa krystalograficznych komórek
elementarnych; * generowanie wejścia dla pakietów chemii kwantowej Gaussian, GAMESS i MOLPRO; * elastyczna architektura
wtyczek i skryptów Pythona.</p>
<p>Avogadro odczytuje formaty plików takie jak: PDB, XYZ, CML, CIF, Molden oraz dane wyjściowe: Gaussian, GAMESS i MOLPRO.</p>
de: >-
<p>Avogadro ist ein System für Molekülgrafiken und -modellierung, das für Moleküle und Biomoleküle gedacht ist. Es kann
Eigenschaften wie Molekülorbitale oder elektrostatische Potentiale visualisieren und enthält einen intuitiven Moleküleditor.</p>
<p>Es verfügt über die folgenden Fähigkeiten: * Molekülmodellierer mit automatischer kraftfeldbasierter Geometrie-Optimierung
* Molekülmechanik einschließlich der Suche mit Bedingungen und Conformern * Visualisierung von Molekülorbitalen und allgemeinen
Isoflächen * Visualisierung von Schwingungen und Darstellung von Schwingungsspektren * Unterstützung von kristallografischen
Einheitszellen * Eingabeerzeugung für die quantenchemischen Pakete Gaussian, GAMESS und MOLPRO * Flexible Erweiterungsarchitektur
und Python-Skripting</p>
<p>Avogadro kann die Dateiformate PDB, XYZ, CML, CIF und Molden sowie die Ausgabe von Gaussian, GAMESS und MOLPRO lesen.</p>
pt_BR: >-
<p>Avogadro é um sistema de modelagem e gráficos moleculares para moléculas e biomoléculas. Pode visualizar propriedades
como orbitais moleculares ou potenciais eletrostáticos e tem um construtor molecular intuitivo.</p>
<p>Inclui os seguintes recursos: * Modelador molecular com otimização automática de geometria baseada em campo de força;
* Mecânica molecular incluindo restrições e buscas de confórmeros; * Visualização de orbitais moleculares e isosuperfícies
gerais; * Visualização de vibrações e plotagem de espectro vibracional; * Suporte para células unitárias cristalográficas;
* Geração de entrada para os pacotes de química quântica Gaussian, GAMESS e MOLPRO; * Arquitetura de extensões flexível
e scripts em Python.</p>
<p>Os formatos de arquivos que o Avogadro pode ler incluem PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, assim como a saída dos pacotes
Gaussian, GAMESS e MOLPRO.</p>
ja: >-
<p>Avogadro は、分子および生体分子をターゲットとする分子描画および 分子モデリングシステムです。分子軌道や静電ポテンシャルなどの分子の物性を 可視化すること、および直感的な分子モデリングを可能とします。</p>
<p>次のような機能があります: * 力場に基づいた配座の自動最適化機能のある分子モデラリングツール * 拘束や配座異性体探索を含む分子力学法ツール * 分子軌道その他のな同値面の可視化 * 振動の視覚化、振動スペクトルのプロット
* 結晶単位格子の編集 * Gaussian, GAMESS および MOLPRO 量子化学パッケージ用の入力データの生成 * 拡張可能なプラグインアーキテクチャ、Python でのスクリプティング</p>
<p>Avogadro は、PDB, XYZ, CML, CIF, Molden ファイルのほか、Gaussian, GAMESS, MOLPRO などの出力ファイルも読み込むことができます。</p>
C: >-
<p>Avogadro is a molecular graphics and modelling system targeted at molecules and biomolecules. It can visualize properties
like molecular orbitals or electrostatic potentials and features an intuitive molecular builder.</p>
<p>Features include: * Molecular modeller with automatic force-field based geometry optimization * Molecular Mechanics
including constraints and conformer searches * Visualization of molecular orbitals and general isosurfaces * Visualization
of vibrations and plotting of vibrational spectra * Support for crystallographic unit cells * Input generation for the
Gaussian, GAMESS and MOLPRO quantum chemistry packages * Flexible plugin architecture and Python scripting</p>
<p>File formats Avogadro can read include PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, as well as Gaussian, GAMESS and MOLPRO output.</p>
en: >-
<p>Avogadro is a molecular graphics and modelling system targeted at molecules and biomolecules. It can visualize properties
like molecular orbitals or electrostatic potentials and features an intuitive molecular builder.</p>
<p>Features include: * Molecular modeller with automatic force-field based geometry optimization * Molecular Mechanics
including constraints and conformer searches * Visualization of molecular orbitals and general isosurfaces * Visualization
of vibrations and plotting of vibrational spectra * Support for crystallographic unit cells * Input generation for the
Gaussian, GAMESS and MOLPRO quantum chemistry packages * Flexible plugin architecture and Python scripting</p>
<p>File formats Avogadro can read include PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, as well as Gaussian, GAMESS and MOLPRO output.</p>
sr: >-
<p>Авогадро је систем молекуларне графике и моделирања намењен молекулима и биомолекулима. Може да прикаже својства као
што су орбите молекула или електростатички потенцијали а одликује га спознатљив изграђивач молекула.</p>
<p>У особености спадају: * Уобличавач молекула са самосталним прилагођавањем геометрије на основу силе поља * Механика
молекула која укључује ограничења и претраге сагласности * Приказивање орбита молекула и опште исо-површине * Приказивање
вибрација и исцртавање вибрационог спектра * Подршка кристалографских поља јединице * Стварање улаза за пакете Гаусове,
ГАМЕС и МОЛПРО квантне хемије * Прилагодљива архитектура прикључка и писање скрипти у Питону</p>
<p>У записе датотека које Авогадро може да чита спадају ПДБ, ХУЗ, ЦМЛ, ЦИФ, Молден, као и Гаусов, ГАМЕС-ов и МОЛПРО излаз.</p>
fr: >-
<p>Avogadro est un système de modélisation et d'imagerie moléculaire visant les molécules et les biomolécules. Il
permet de visualiser des propriétés comme les orbites moléculaires ou les potentiels électrostatiques et dispose d'un
constructeur de molécules intuitif.</p>
<p>Fonctions disponibles : — modeleur moléculaire avec optimisation géométrique basée sur les champs de force automatique ;
— mécanique moléculaire incluant des recherches de contraintes et de conformation ; — visualisation des orbites moléculaires
et d'isosurfaces générales ; — visualisation de vibrations et graphique du spectre de vibration ; — gestion des
cellules cristallographiques ; — création d'entrée pour des paquets chimiques Gaussian, GAMESS and MOLPRO ;
— architecture de greffon flexible et script Python.</p>
<p>Les formats de fichiers qu'Avogadro peut lire incluent PDB, XYZ, CML, CIF, Molden ainsi que les sorties Gaussian,
GAMESS and MOLPRO.</p>
it: >-
<p>Avogadro è un sistema di grafica e modellamento molecolare pensato per molecole e biomolecole. Può visualizzare proprietà
come orbitali molecolari o potenziali elettrostatici e ha uno strumento di uso intuitivo per la creazione di molecole.</p>
<p>Le sue caratteristiche includono: * modellatore molecolare con ottimizzazione automatica geometrica basata sui
campi di forze; * meccanica molecolare comprese ricerche di limiti e conformazioni; * visualizzazione di orbitali molecolari
e iso-superfici generiche; * visualizzazione di vibrazioni e disegno degli spettri vibrazionali; * gestione di unità
a cella cristallografiche; * generazione di input per i pacchetti di chimica quantistica Gaussian, GAMESS e MOLPRO;
* architettura flessibile a plugin e script Python.</p>
<p>Tra i formati di file che Avogadro può leggere sono inclusi PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, oltre all'output di Gaussian,
GAMESS e MOLPRO.</p>
da: >-
<p>Avogrado er et molekylært grafik- og modelsystem for molekyler og biomolekyler. Systemet kan visualisere egenskaber
såsom molekyleorbitaler eller elektrostatiske potentialer og indeholder et intuitivt molekylært byggeprogram.</p>
<p>Inkluderede funktioner: * Molekylært byggeprogram med automatisk kraftfeltbaseret geometrioptimering * Molekylære
mekanikker inklusiv begrænsede søgninger og conformersøgninger * Visualisering af molekylære orbitaler og generelle
isooverflader * Visualisering af vibrationer og plot af vibrationelle spektra * Understøttelse for krystallografiske
enhedsceller * Inddataoprettelse for kvantumkemipakkerne Gaussian, GAMESS og MOLPRO. * Fleksibel arkitektur for udvidelsesmoduler
og Pythonskripter</p>
<p>Filformater, som Avogrado kan læse, inkluderer PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, samt Gaussian-, GAMESS- og MOLPRO-resultater.</p>
Categories:
- Science
- Chemistry
- Physics
- Education
Icon:
cached:
- name: avogadro_avogadro-icon.png
width: 64
height: 64
- name: avogadro_avogadro-icon.png
width: 128
height: 128
Provides:
mimetypes:
- chemical/x-cif
- chemical/x-cml
- chemical/x-daylight-smiles
- chemical/x-gamess-input
- chemical/x-gamess-output
- chemical/x-gaussian-log
- chemical/x-mopac-out
- chemical/x-pdb
- chemical/x-xyz
- chemical/x-gaussian-checkpoint
- chemical/x-gaussian-cube
- chemical/x-qchem-output
---
Type: desktop-application
ID: avogadro.desktop
Package: avogadro
Name:
C: Avogadro
Summary:
fr: Système de modélisation et d'imagerie moléculaire
C: Molecular Graphics and Modelling System
da: Molekulært grafik- og modelsystem
it: Sistema di grafica e modellamento molecolare
pl: System do molekularnego modelowania i wizualizacji
de: System für Molekülgrafiken und -modellierung
ru: Система для молекулярного моделирования и визуализации
Description:
pl: >-
<p>Avogadro jest systemem do molekularnego modelowania oraz wizualizacji cząsteczek i biocząsteczek. Może wizualizować
właściwości cząsteczek, takie jak orbitale lub potencjały elektrostatyczne, a ponadto udostępnia intuicyjne narzędzie
do budowania cząsteczek.</p>
<p>Podstawowe możliwości: * molekularne modelowanie z automatyczną optymalizacją opartą na geometrii pól siłowych;
* mechanika molekularna obejmująca wyszukiwanie według ograniczeń i konformacji; * wizualizacja orbitali molekularnych
oraz ogólnych izopowierzchni; * wizualizacja drgań i kreślenie widm oscylacyjnych; * obsługa krystalograficznych komórek
elementarnych; * generowanie wejścia dla pakietów chemii kwantowej Gaussian, GAMESS i MOLPRO; * elastyczna architektura
wtyczek i skryptów Pythona.</p>
<p>Avogadro odczytuje formaty plików takie jak: PDB, XYZ, CML, CIF, Molden oraz dane wyjściowe: Gaussian, GAMESS i MOLPRO.</p>
de: >-
<p>Avogadro ist ein System für Molekülgrafiken und -modellierung, das für Moleküle und Biomoleküle gedacht ist. Es kann
Eigenschaften wie Molekülorbitale oder elektrostatische Potentiale visualisieren und enthält einen intuitiven Moleküleditor.</p>
<p>Es verfügt über die folgenden Fähigkeiten: * Molekülmodellierer mit automatischer kraftfeldbasierter Geometrie-Optimierung
* Molekülmechanik einschließlich der Suche mit Bedingungen und Conformern * Visualisierung von Molekülorbitalen und allgemeinen
Isoflächen * Visualisierung von Schwingungen und Darstellung von Schwingungsspektren * Unterstützung von kristallografischen
Einheitszellen * Eingabeerzeugung für die quantenchemischen Pakete Gaussian, GAMESS und MOLPRO * Flexible Erweiterungsarchitektur
und Python-Skripting</p>
<p>Avogadro kann die Dateiformate PDB, XYZ, CML, CIF und Molden sowie die Ausgabe von Gaussian, GAMESS und MOLPRO lesen.</p>
pt_BR: >-
<p>Avogadro é um sistema de modelagem e gráficos moleculares para moléculas e biomoléculas. Pode visualizar propriedades
como orbitais moleculares ou potenciais eletrostáticos e tem um construtor molecular intuitivo.</p>
<p>Inclui os seguintes recursos: * Modelador molecular com otimização automática de geometria baseada em campo de força;
* Mecânica molecular incluindo restrições e buscas de confórmeros; * Visualização de orbitais moleculares e isosuperfícies
gerais; * Visualização de vibrações e plotagem de espectro vibracional; * Suporte para células unitárias cristalográficas;
* Geração de entrada para os pacotes de química quântica Gaussian, GAMESS e MOLPRO; * Arquitetura de extensões flexível
e scripts em Python.</p>
<p>Os formatos de arquivos que o Avogadro pode ler incluem PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, assim como a saída dos pacotes
Gaussian, GAMESS e MOLPRO.</p>
ja: >-
<p>Avogadro は、分子および生体分子をターゲットとする分子描画および 分子モデリングシステムです。分子軌道や静電ポテンシャルなどの分子の物性を 可視化すること、および直感的な分子モデリングを可能とします。</p>
<p>次のような機能があります: * 力場に基づいた配座の自動最適化機能のある分子モデラリングツール * 拘束や配座異性体探索を含む分子力学法ツール * 分子軌道その他のな同値面の可視化 * 振動の視覚化、振動スペクトルのプロット
* 結晶単位格子の編集 * Gaussian, GAMESS および MOLPRO 量子化学パッケージ用の入力データの生成 * 拡張可能なプラグインアーキテクチャ、Python でのスクリプティング</p>
<p>Avogadro は、PDB, XYZ, CML, CIF, Molden ファイルのほか、Gaussian, GAMESS, MOLPRO などの出力ファイルも読み込むことができます。</p>
C: >-
<p>Avogadro is a molecular graphics and modelling system targeted at molecules and biomolecules. It can visualize properties
like molecular orbitals or electrostatic potentials and features an intuitive molecular builder.</p>
<p>Features include: * Molecular modeller with automatic force-field based geometry optimization * Molecular Mechanics
including constraints and conformer searches * Visualization of molecular orbitals and general isosurfaces * Visualization
of vibrations and plotting of vibrational spectra * Support for crystallographic unit cells * Input generation for the
Gaussian, GAMESS and MOLPRO quantum chemistry packages * Flexible plugin architecture and Python scripting</p>
<p>File formats Avogadro can read include PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, as well as Gaussian, GAMESS and MOLPRO output.</p>
en: >-
<p>Avogadro is a molecular graphics and modelling system targeted at molecules and biomolecules. It can visualize properties
like molecular orbitals or electrostatic potentials and features an intuitive molecular builder.</p>
<p>Features include: * Molecular modeller with automatic force-field based geometry optimization * Molecular Mechanics
including constraints and conformer searches * Visualization of molecular orbitals and general isosurfaces * Visualization
of vibrations and plotting of vibrational spectra * Support for crystallographic unit cells * Input generation for the
Gaussian, GAMESS and MOLPRO quantum chemistry packages * Flexible plugin architecture and Python scripting</p>
<p>File formats Avogadro can read include PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, as well as Gaussian, GAMESS and MOLPRO output.</p>
sr: >-
<p>Авогадро је систем молекуларне графике и моделирања намењен молекулима и биомолекулима. Може да прикаже својства као
што су орбите молекула или електростатички потенцијали а одликује га спознатљив изграђивач молекула.</p>
<p>У особености спадају: * Уобличавач молекула са самосталним прилагођавањем геометрије на основу силе поља * Механика
молекула која укључује ограничења и претраге сагласности * Приказивање орбита молекула и опште исо-површине * Приказивање
вибрација и исцртавање вибрационог спектра * Подршка кристалографских поља јединице * Стварање улаза за пакете Гаусове,
ГАМЕС и МОЛПРО квантне хемије * Прилагодљива архитектура прикључка и писање скрипти у Питону</p>
<p>У записе датотека које Авогадро може да чита спадају ПДБ, ХУЗ, ЦМЛ, ЦИФ, Молден, као и Гаусов, ГАМЕС-ов и МОЛПРО излаз.</p>
fr: >-
<p>Avogadro est un système de modélisation et d'imagerie moléculaire visant les molécules et les biomolécules. Il
permet de visualiser des propriétés comme les orbites moléculaires ou les potentiels électrostatiques et dispose d'un
constructeur de molécules intuitif.</p>
<p>Fonctions disponibles : — modeleur moléculaire avec optimisation géométrique basée sur les champs de force automatique ;
— mécanique moléculaire incluant des recherches de contraintes et de conformation ; — visualisation des orbites moléculaires
et d'isosurfaces générales ; — visualisation de vibrations et graphique du spectre de vibration ; — gestion des
cellules cristallographiques ; — création d'entrée pour des paquets chimiques Gaussian, GAMESS and MOLPRO ;
— architecture de greffon flexible et script Python.</p>
<p>Les formats de fichiers qu'Avogadro peut lire incluent PDB, XYZ, CML, CIF, Molden ainsi que les sorties Gaussian,
GAMESS and MOLPRO.</p>
it: >-
<p>Avogadro è un sistema di grafica e modellamento molecolare pensato per molecole e biomolecole. Può visualizzare proprietà
come orbitali molecolari o potenziali elettrostatici e ha uno strumento di uso intuitivo per la creazione di molecole.</p>
<p>Le sue caratteristiche includono: * modellatore molecolare con ottimizzazione automatica geometrica basata sui
campi di forze; * meccanica molecolare comprese ricerche di limiti e conformazioni; * visualizzazione di orbitali molecolari
e iso-superfici generiche; * visualizzazione di vibrazioni e disegno degli spettri vibrazionali; * gestione di unità
a cella cristallografiche; * generazione di input per i pacchetti di chimica quantistica Gaussian, GAMESS e MOLPRO;
* architettura flessibile a plugin e script Python.</p>
<p>Tra i formati di file che Avogadro può leggere sono inclusi PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, oltre all'output di Gaussian,
GAMESS e MOLPRO.</p>
da: >-
<p>Avogrado er et molekylært grafik- og modelsystem for molekyler og biomolekyler. Systemet kan visualisere egenskaber
såsom molekyleorbitaler eller elektrostatiske potentialer og indeholder et intuitivt molekylært byggeprogram.</p>
<p>Inkluderede funktioner: * Molekylært byggeprogram med automatisk kraftfeltbaseret geometrioptimering * Molekylære
mekanikker inklusiv begrænsede søgninger og conformersøgninger * Visualisering af molekylære orbitaler og generelle
isooverflader * Visualisering af vibrationer og plot af vibrationelle spektra * Understøttelse for krystallografiske
enhedsceller * Inddataoprettelse for kvantumkemipakkerne Gaussian, GAMESS og MOLPRO. * Fleksibel arkitektur for udvidelsesmoduler
og Pythonskripter</p>
<p>Filformater, som Avogrado kan læse, inkluderer PDB, XYZ, CML, CIF, Molden, samt Gaussian-, GAMESS- og MOLPRO-resultater.</p>
Categories:
- Science
- Chemistry
- Physics
- Education
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mimetypes:
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- chemical/x-gaussian-checkpoint
- chemical/x-gaussian-cube
- chemical/x-qchem-output